Структура администрации городского поселения Новоаганск
1. Заместитель главы городского поселения.
2. Отдел финансов.
3. Отдел экономики.
4. Отдел по управлению муниципальным имуществом.
5. Отдел правового и кадрового обеспечения.
6. Отдел организации деятельности администрации.
7. Служба жилищно-коммунального хозяйства и транспорта.
8. Служба по работе с населением села Варьеган.
9. Служба по делам гражданской обороны, чрезвычайным ситуациям и пожарной безопасности.
10. Военно-учетный стол.